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SDS-PAGE电泳不仅可用于检测蛋白质的相对分子质量，而且也是分离纯化蛋白质的重要工具之一，随着蛋白质技术的微量化，有必要从PAGE凝胶中回收蛋白质以用于制备抗体、用于免疫印迹实验、用于氨基酸组分分析或末端序列测定等。

• 简单，不需要购买复杂而昂贵的仪器设备（如电洗脱仪）。
  
• 适用于变性胶（SDS-PAGE）和非变性胶（如Blue PAGE）。
  
• 蛋白的回收率一般在50～90%之间（跟蛋白质大小，洗脱时间相关）。
  
• 回收的蛋白可用于后续多种实验，包括2-D电泳、质谱测序等。

• 按常规方法进行变性SDS-PAGE、尿素-PAGE，Tricine-SDS-PAGE电泳，或非变性蛋白电泳，如Bule PAGE。由于PAGE胶固定和染色后，蛋白回收效果很差，所以建议把蛋白样品同时上样到多个孔中并电泳。
  
• 电泳结束后，在对PAGE胶进行固定和染色时，切下其中一个样孔所对应的胶条进行固定和染色。
  
• 将出现蛋白条带后的胶条放回到在整个PAGE胶中此胶条切除前的位置，通过胶条上的蛋白条带来找到在未染色胶上该蛋白预计出现的区域，并切下此区域的PAGE胶（含未固定和为染色的目的蛋白）进行回收。
  
• 去除含目的蛋白的胶条的多余凝胶，否则它们会影响蛋白回收效率。
  
• 将修整后的PAGE胶条转移到一个干净的1.5mL塑料离心管中。
  
• 用移液枪枪头充分将PAGE胶条戳击成尽可能细小的碎片。
  
• 加入200μL PAGE胶蛋白回收试剂溶液A，盖好盖子后平放在桌面摇床上，用胶带固定，4℃摇晃洗脱至少2～16小时（过夜）。
  
• 在样品摇晃时，将PAGE胶蛋白回收试剂溶液B放在-20℃冰箱预冷待用。
  
• 将含捣碎PAGE胶条的离心管在10000g离心10分钟，小心转移上清液到一个新的1.5mL塑料离心管中。注意转移时千万不要吸走PAGE碎胶。
  
• 在含上清液的离心管中加入5倍体积的、预先冷却的PAGE胶蛋白回收试剂溶液B，充分摇晃混匀。
  
• 将离心管在-20℃放置30分钟。
  
• 室温12000g离心20分钟，小心弃上清。
  
• 打开盖在室温下让离心管充分晾干，关底沉淀即为回收的蛋白质。回收的蛋白质可溶解在适当的缓冲液中，可用于后续实验（2-D电泳、质谱测序等）。